Tras finalizar la liga, se disputa la Copa Diputación de Baloncesto Masculino de Guadalajara 2016-17 con la presencia de 15 equipos y un formato de playoff con consolación durante el Mes de Mayo de 2017.  Apasionantes los cruces tras el sorteo realizado el 7 de Mayo de 2017 a las 17:30 en el Polideportivo San José Previo a la Final de Liga.

Octavos de Final1:

El equipo del Baloncesto86 Yebes-Valdeluz pasa de ronda por sorteo.

Octavos de Final2:

FechaEquiposHora/ResultadosRecinto
Baloncesto Serracines
EDM Sacedon

Octavos de Final3:

FechaEquiposHora/ResultadosRecinto
C.B. Amigos Urban Planet
Guadalajara Bees

Octavos de Final4:

FechaEquiposHora/ResultadosRecinto
C.B. Cabanillas A
Recuperaciones Azuqueca – Villa de Meco – CBV

Octavos de Final5:

FechaEquiposHora/ResultadosRecinto
JKLÑ
Believers

Octavos de Final6:

FechaEquiposHora/ResultadosRecinto
Alcarria Heat
C.B. Cabanillas B

Octavos de Final7:

FechaEquiposHora/ResultadosRecinto
Flamin Guays
C.B. Iriepal

Octavos de Final8:

FechaEquiposHora/ResultadosRecinto
Jesthisa Desarrollos Inmobiliarios
C.B. Horche